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VESTAでLaMnO3ペロフスカイト

VESTA - Visualization for Electronic and STructual Analysisを利用してLaMnO3ペロフスカイトの結晶構造を描画しました。

LaMnO3pv.png


結晶構造の描画


VESTAで結晶構造を表示するためには、なんらかのデータベースから結晶構造データ(.cifフィアルや.vestaファイル)を入手するか、或いは、自分で結晶構造のパラメターを入力する必要があります。

結晶構造のパラメータの入力の仕方を含むVESTAの使い方は、以下のサイトで分かりやすく紹介されています。



また、結晶構造データベースとしての有名どころは、以下の様なものがあります。


American Mineralogist Crystal Structure DatabaseGeneral Searchに化学式などを入力して検索すると、結晶構造のパラメータと.cifファイルの一覧が表示されます。


LaMnO3のパラメータ


今回は、一例としてLaMn3の結晶構造を描画します。
結晶構造のパラメータはTutorial for XtalEditや http://kotliar6.rutgers.edu/udo/prof/projects/lda/tutorial/tut_01.htm のInternet Archiveのアーカイブのものを利用します。

空間群は62番で、格子定数は以下の通りです。

  • a = 5.742 Å
  • b = 7.668 Å
  • c = 5.332 Å


単位格子内の原子位置はTable.1の通りです。

Wyckoffx/ay/bz/c
La4c0.5491/40.010
Mn4a000
OI4c-0.0141/4-0.070
OII8d0.3090.0390.224
table.1: LaMnO3単位格子内の原子位置


これらの情報を信州大学 情報科学演習空間群を利用して、さらに複雑な構造を描くに倣って入力します。


第一原理計算の入力ファイルに関して


AkaiKKR(Machikaneyama)などの第一原理計算のための入力には、結晶構造と原子位置を入力する必要があります。AkaiKKRの入力支援にはXtalEditというソフトがありますが、VESTAでもある程度のことはできそうだと言う感触はあります。

第一原理計算の入力ファイル作成に関して参考になりそうなURLを列挙しておきます。



関連エントリ




参考URL




付録


このエントリで使用したVESTAの結晶構造ファイルを添付します。ファイル名末尾の".txt"を削除して、"_"を"."に変更すれば使えるはずです。(参考:ねがてぃぶろぐの付録)


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